為(wei) 防止滴頭堵塞，要選用溶解性好的肥料，如尿素、磷酸二氫鉀等。施用複合肥時，盡量選擇完全速溶性的專(zhuan) 用肥料。確需施用不能完全溶解的肥料時，必須先將肥料在盆或桶等容器內(nei) 溶解，待其沉澱後，將上部溶液倒入施肥罐進入滴灌係統，剩餘(yu) 殘渣施入土中。
一般將有機肥和磷肥作基肥使用。因為(wei) 有的磷肥，如過磷酸鈣隻是部分溶解，殘渣易堵塞噴頭。氨水中的氨易揮發，而且要改變水的酸堿性，易引起水中的鈣、鎂沉澱。
要選擇對灌溉係統腐蝕性小的肥料。如硫酸銨、硝酸銨對鍍鋅鐵的腐蝕嚴(yan) 重，而對不鏽鋼基本無腐蝕；磷酸對不鏽鋼有輕度的腐蝕；尿素對鋁板、不鏽鋼、銅無腐蝕，對鍍鋅鐵有輕度的腐蝕。